Если подразделение само платит зарплату сотрудникам

Если обособленное подразделение организации производит выплату дохода своим сотрудникам, то такое обособленное подразделение исполняет обязанности юридического лица как налогового агента.

Такое обособленное подразделение обязано исчислять, уплачивать и перечислять в бюджет по месту своего учета НДФЛ с доходов своих сотрудников, и предоставлять сведения по форме 2-НДФЛ в налоговые органы по месту своего учета. (Письмо Минфина РФ от 16/01/2007 N 03-04-06-01/4)