Нужно ли предоставлять документы в ФНС если истек срок 3 месяца?

Всем доброго дня! Буду благодарна,если кто-то даст пояснения: если не были предоставлены вовремя документы по требованию (договор с самозанятым),нужно ли их направлять спустя 3 месяца,фнс проверяет на факт подмены трудового договора. Или может начислить ндфл и страх.,если не предоставим доки. Требование пришло в январе в лк физлица,не знали,т.к в контур не поступило,выкатили штраф,поехали выяснять,вот теперь думаем что делать.