Вот ряд тезисов, доказывающих противоположное.

Плательщики НДФЛ — это физические лица — налоговые резиденты РФ, получающие доход от источников в РФ и за пределами страны (подп. 1, 2 ст. 207, ст. 209 НК). Налоговыми агентами признаются российские организации, от которых или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доходы. Налоговые агенты обязаны исчислить, удержать и уплатить сумму НДФЛ при фактической выплате дохода (подп. 1 п. 3 ст. 24, п. 1, 4 ст. 226 НК).

Самозанятые фактически внесли НПД в бюджет (ведь ИФНС оспаривает суть отношений, а не указывает на доказанность неуплаты налога самозанятыми). Налоговики должны принимать меры для того, чтобы установить реальный размер налоговых обязательств и исключить возможность вменения к уплате налога в большем размере, чем установлено законом (на недопустимость этого указывал КС (постановление от 28.03.2000 № 5-П, определение от 27.02.2018 № 526-О)).

Доначисление НДФЛ в излишнем размере, без учета уже уплаченных суммы — по сути, дополнительная санкция, которая налагается за пределами необходимых мер для обеспечения справедливости, всеобщности налогообложения и противодействия злоупотреблениям в налоговой сфере.

На недопустимость подобного неоднократно указывал ВС (определения от 23.03.2022 № 307-ЭС21-17087, от 17.10.2022 № 301-ЭС22-11144). И довод о том, что плательщики НПД самостоятельно могут аннулировать ранее сформированные чеки и вернуть налог, ничего в данном случае не меняет (постановления АС Западно-Сибирского округа от 07.09.2023, дело № А75-18649/2022, от 08.07.2024 № А46-2537/2023).

Самозанятых признали работниками: как рассчитываются доначисления по НДФЛ